MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio alaskensis G20 chromosome

Total Repeats: 11394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007519	GCAG	2	8	51	58	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007519	CATGC	2	10	141	150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_007519	CCG	3	9	1500	1508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_007519	AT	3	6	1567	1572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007519	AGT	2	6	1577	1582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007519	CTA	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007519	ATA	2	6	1619	1624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007519	CTT	2	6	8520	8525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007519	ATC	2	6	8545	8550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007519	T	6	6	8571	8576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007519	GGC	2	6	8681	8686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007519	GC	3	6	8714	8719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007519	GC	3	6	8747	8752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007519	ATC	2	6	8770	8775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007519	CGG	2	6	8787	8792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007519	GGC	2	6	8905	8910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007519	GC	3	6	8938	8943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007519	GC	3	6	8971	8976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007519	ATC	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007519	GGC	2	6	9133	9138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007519	GC	3	6	9166	9171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007519	GC	3	6	9199	9204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007519	ATC	2	6	9222	9227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007519	CGG	2	6	9239	9244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007519	GCG	2	6	9329	9334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007519	T	7	7	9345	9351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007519	CAGG	2	8	10118	10125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007519	T	7	7	10151	10157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007519	GGT	2	6	10163	10168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007519	TGA	2	6	10184	10189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007519	GGT	2	6	10305	10310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007519	GCA	2	6	10311	10316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007519	T	6	6	11613	11618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007519	CCG	2	6	11646	11651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007519	CGG	2	6	13506	13511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007519	CCG	2	6	13516	13521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007519	TGCA	2	8	13572	13579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007519	GGC	2	6	13598	13603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007519	TTA	2	6	13646	13651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007519	GCA	2	6	13682	13687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007519	A	7	7	13690	13696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007519	CTG	2	6	15202	15207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007519	GCG	2	6	15240	15245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007519	CTT	2	6	15250	15255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007519	GT	3	6	15264	15269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007519	CGTGC	2	10	15287	15296	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007519	ATTG	2	8	15304	15311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007519	AGG	2	6	17621	17626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007519	ATG	2	6	17647	17652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007519	CTG	2	6	17675	17680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007519	ACG	2	6	17730	17735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007519	ATG	2	6	17779	17784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007519	CCG	2	6	18863	18868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007519	C	8	8	21687	21694	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_007519	TGC	2	6	21696	21701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007519	T	7	7	21723	21729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007519	A	6	6	21751	21756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007519	AACCGG	2	12	21799	21810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007519	ATC	2	6	21898	21903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007519	CCG	2	6	21911	21916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_007519	T	6	6	21924	21929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007519	GC	3	6	21989	21994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007519	GCG	2	6	22034	22039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007519	ATC	2	6	22122	22127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007519	CTGC	2	8	22131	22138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007519	T	6	6	22148	22153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007519	GC	3	6	22213	22218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007519	GGT	2	6	22226	22231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007519	GCG	2	6	22258	22263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007519	CGC	2	6	22293	22298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007519	ATC	2	6	22346	22351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007519	CCG	2	6	22359	22364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_007519	GCG	2	6	22486	22491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007519	ATC	2	6	22574	22579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007519	CCG	2	6	22587	22592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007519	GGAT	2	8	22604	22611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007519	A	6	6	22626	22631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007519	TC	4	8	24627	24634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007519	TCC	2	6	24652	24657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007519	CAA	2	6	24686	24691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007519	CT	4	8	25912	25919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007519	GGC	2	6	26039	26044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007519	ATG	2	6	26045	26050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007519	GTT	2	6	26093	26098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007519	TGA	2	6	26139	26144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007519	GCA	2	6	26190	26195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007519	A	6	6	26198	26203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007519	CTG	2	6	27268	27273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007519	CGC	2	6	27274	27279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007519	TG	3	6	27289	27294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007519	A	6	6	27298	27303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007519	CCG	2	6	27334	27339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007519	CGGA	2	8	27364	27371	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007519	TGG	2	6	27382	27387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007519	CGC	2	6	27398	27403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007519	T	6	6	27484	27489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007519	TGA	2	6	27507	27512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007519	CGG	2	6	27646	27651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007519	GAT	2	6	27659	27664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007519	TGC	2	6	27723	27728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007519	GCATG	2	10	27739	27748	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_007519	GTT	2	6	27951	27956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007519	CAT	2	6	28007	28012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007519	CCG	2	6	28052	28057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007519	TCA	2	6	28072	28077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007519	GT	4	8	28130	28137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007519	CGGG	2	8	28906	28913	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007519	TCC	2	6	30310	30315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_007519	A	6	6	30333	30338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007519	T	6	6	30383	30388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007519	GC	3	6	30401	30406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007519	AGG	2	6	30407	30412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007519	AAT	2	6	30419	30424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007519	GGC	2	6	30428	30433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007519	CGG	2	6	30442	30447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007519	CTGAC	2	10	30449	30458	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_007519	ATG	2	6	30464	30469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007519	GAAA	2	8	30511	30518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007519	CGG	2	6	30538	30543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007519	ATG	2	6	33214	33219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007519	GCG	3	9	33232	33240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007519	TGT	2	6	33268	33273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007519	GCG	2	6	33321	33326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007519	TGCC	2	8	33383	33390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007519	CCG	2	6	34629	34634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007519	A	7	7	34693	34699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007519	CTTTT	2	10	34716	34725	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007519	A	6	6	34729	34734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007519	A	6	6	34743	34748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007519	TGA	2	6	37452	37457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007519	GCC	2	6	37465	37470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_007519	GCGG	2	8	37484	37491	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007519	T	7	7	37493	37499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007519	ACG	2	6	37536	37541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007519	CTGC	2	8	37554	37561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007519	GGCA	2	8	39636	39643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007519	AGG	2	6	39819	39824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007519	GAT	2	6	41008	41013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007519	CCG	2	6	41031	41036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_007519	T	6	6	41057	41062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007519	T	6	6	41076	41081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007519	TTG	2	6	41090	41095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007519	TG	3	6	41094	41099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007519	TGC	2	6	41150	41155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007519	AAT	2	6	41175	41180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007519	AGAAT	2	10	41197	41206	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007519	TGCTGT	2	12	41357	41368	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_007519	A	7	7	41376	41382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007519	GCTG	2	8	42154	42161	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_007519	A	6	6	42275	42280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007519	TGTT	2	8	42304	42311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007519	TCC	2	6	45351	45356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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154	NC_007519	GTGC	2	8	45509	45516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_007519	A	8	8	45567	45574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007519	GGAAA	2	10	45578	45587	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
157	NC_007519	TGCCG	2	10	45614	45623	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
158	NC_007519	CGGG	2	8	45665	45672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
159	NC_007519	CG	3	6	47475	47480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_007519	TTC	2	6	47568	47573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_007519	GCG	2	6	47577	47582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_007519	GGC	2	6	47597	47602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_007519	GCG	2	6	47629	47634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_007519	CCG	2	6	47681	47686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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171	NC_007519	TCCG	2	8	49940	49947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
172	NC_007519	CCT	2	6	50936	50941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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182	NC_007519	CCG	2	6	51697	51702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_007519	GCC	2	6	51714	51719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_007519	GAA	2	6	51749	51754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_007519	CGC	2	6	51875	51880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_007519	CTG	2	6	51914	51919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_007519	TCG	2	6	55913	55918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_007519	CCGG	2	8	56917	56924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
196	NC_007519	C	7	7	56961	56967	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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280	NC_007519	AAT	2	6	70310	70315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_007519	GGC	2	6	70432	70437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_007519	GCTAG	2	10	70493	70502	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
286	NC_007519	GGA	2	6	70558	70563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
287	NC_007519	GGC	2	6	70578	70583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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427	NC_007519	GGC	2	6	95042	95047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_007519	GCAGA	2	10	95112	95121	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
429	NC_007519	CATG	2	8	95128	95135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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433	NC_007519	CGC	2	6	95281	95286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_007519	GCC	2	6	95318	95323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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437	NC_007519	CGG	2	6	97797	97802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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440	NC_007519	A	6	6	98697	98702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_007519	CTG	2	6	98738	98743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_007519	CGAG	2	8	98757	98764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_007519	T	6	6	103584	103589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_007519	GGA	2	6	103737	103742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_007519	CGG	2	6	104376	104381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_007519	CAA	2	6	104405	104410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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464	NC_007519	CGC	2	6	106766	106771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
465	NC_007519	CGG	2	6	108450	108455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_007519	CCGG	2	8	108468	108475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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475	NC_007519	TGC	2	6	110510	110515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
476	NC_007519	AGT	2	6	110568	110573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_007519	CTGC	2	8	111573	111580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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486	NC_007519	GCA	2	6	114504	114509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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491	NC_007519	CAGA	2	8	117604	117611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_007519	GCC	2	6	117627	117632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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